简单线性基线
别名: linear baseline · baseline gap
用作扰动预测参照的简单线性模型。Ahlmann-Eltze 等报告深度学习基因扰动预测尚未超越它们,后续预印本报告该基线差距仍然存在。 VC0048 VC0054 · 预印本 VC0053 · 预印本
待审阅 版本 0.1.0 · 状态:初稿 · 最近专家审阅:尚未审阅
关系
| 主语 | 关系 | 宾语 | 置信度 | 证据(角色) |
|---|---|---|---|---|
| 扰动反应预测 | 基准评测于 | 简单线性基线 | 高 | VC0048 基准 VC0049 基准 深度模型尚不能稳定超越简单线性基线。 来源: 虚拟细胞的验证:基准、基线与批评 |
| X-Cell | 基准评测于 | 简单线性基线 | 低 | VC0033 · 预印本 支持 VC0048 反驳 X-Cell(预印本,未经同行评审)声称超越线性基线,而 Nature Methods 基准发现此前的深度模型未能做到;VC0048 并未测试 X-Cell,“反驳”仅表示存在张力而非证伪。需复核。 来源: AI 虚拟细胞模型 · 虚拟细胞的验证:基准、基线与批评 |
出现在研究专题中
- 胶质母细胞瘤间充质样(MES 样)细胞状态 (细胞状态)
- AI 虚拟细胞模型 (模型)
- 虚拟细胞的验证:基准、基线与批评 (验证)
出现在文献库条目中(4)
标题、标签或一句话摘要与该实体匹配的条目(由数据自动得出),以及用作描述证据的条目。
- VC0054 · 预印本 An Empirical Comparison of Virtual Cell Models: Perturbation Prediction, Representation, and the Baseline Gap — Denvis O., Research Square, 2026
- VC0110 Causal Models Need Causal Data - Xaira's X-Cell (podcast) — Latent Space, Latent Space podcast, 2026
- VC0053 · 预印本 Signal, Bounds, and Baselines: Principles for Evaluating Virtual Cell Perturbation Models — Vollenweider M, Bühlmann P., bioRxiv, 2026
- VC0048 Deep-learning-based gene perturbation effect prediction does not yet outperform simple linear baselines. — Ahlmann-Eltze C, Huber W, Anders S., Nature methods, 2025
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